Обнаженное тело мужчины плавает в светло-желтой жидкости. Периодически тело сотрясают судороги. Изо рта мужчины выходит трубка, блокируя дыхательные пути, и мужчина задыхается от нехватки воздуха. Это Малдер. Скалли открывает глаза и в ужасе вскрикивает. Она сидит в кровати в своей больничной палате, постепенно осознавая, что все увиденное было ночным кошмаром. Утром Скалли одевается, собираясь ехать на работу, но застывает перед зеркалом. Она смотрит на себя как на незнакомого человека. Погрузившись в свои беспокойные мысли, Скалли идет по коридорам ФБР в кабинет Малдера. Из состояния отрешенности ее выводит вид агентов, опустошающих ящики с Секретными Материалами. Скалли не верит, что изъятие документов проводится исключительно в целях поиска Малдера. Вместе со Скиннером Скалли направляется к человеку, чей приказ выполнют агенты - к недавно продвинувшемуся по службе и ставшему заместителем директора Кершу. Керш заявляет, что ожидает от Скалли и Скиннера сотрудничества как от двух главных свидетелей, которые должны дать показания агенту Джону Доггетту, руководителю специализированного подразделения, направленного на поиски Малдера. Керш объявляет, что рассказы о пришельцах в официальных показаниях будут стоить Скалли и Скиннеру работы. Скалли и Скиннер идут в офис, занимаемый сотрудниками специального подразделения, чтобы изложить свои версии событий. Скиннер не хочет врать, но по пути Скалли убеждает его, что помочь Малдеру они смогут только оставаясь в ФБР. Пока Скалли, сидя в коридоре, ожидает своего допроса, устроившийся рядом агент заводит с ней разговор. Заявив, что он был знаком с Малдером, агент пытается убедить Скалли, что Малдер многое скрывал от нее и вел вторую, неизвестную ей жизнь. Таким образом Скалли знакомится с агентом Доггеттом, начальником специализированного подразделения, которому поручили поиск Малдера. Вернувшись домой, Скалли поднимает базу данных ФБР и изучает личное дело агента Доггетта. Бывший морской пехотиниц и бывший детектив департамента полиции Нью-Йорка имеет немало благодарностей и похвал. Пока Скалли просматривает документы, ее лицо странно искажается. Скалли вскакивает и бросается в туалет, борясь с тошнотой. Тем же вечером, оставив на автоответчике сообщение для своей матери Скалли слышит в трубке щелчок. Подойдя к окну, она замечает внизу смотрящего на нее мужчину. Скалли звонит Доггетту и обвиняет его в начавшейся слежке, но Доггетт смущен неожиданными обвинениями. Заметив тень ног под ее дверью, Скалли хватает пистолет и бросается в погоню, но налетает на домовладельца, который только что видел в здании Малдера. Скалли бежит обратно в свою квартиру. Квартира по-прежнему пуста, но со стола пропал компьютер. Скалли едет в дом Малдера. В его квартире тихо и пусто. Компьютер Малдера также исчез. Скалли берет одну из смятых рубашек напарника, словно надеясь, что его вещь соединит ее с Малдером, и ложится на незастеленную постель, прижимая к себе рубашку. В своей тоске она закрывает глаза. Скалли снова видит Малдера. На этот раз он сидит на стуле. Его голова, руки и ноги закреплены стержнями. Кожа на щеках натянута металлическими скрепками. Два металлических устройства с зубцами выдвигаются сверху вниз, в его ноздри, пока вращающееся сверло проходит в его рот, прокалывая небо. Малдер тщетно борется с загадочными устройствами, крича от боли. В то же время Скиннер втайне встречается с Одинокими Стрелками. Встреча проходит под тремя спутниковыми тарелками, к которым сумели подключиться Стрелки. Стрелки засекли передвижение НЛО к северо-западу над Тихим океаном и пытаются отследить курс космического корабля, предположительно похитившего Малдера. К сожалению, Стрелки не могут выяснить, где в следующий раз опустится НЛО. Утром, проснувшись в постели Малдера, Скалли видит перед собой агента Доггетта. Скалли бросает Доггетту обвинения в шпионаже, но Доггетт объясняет, что пришел в квартиру Малдера за уликами. Он показывает Скалли счета за аренду машины, которые он нашел в ящиках Малдера, и спрашивает Скалли, куда мог ездить ее напарник. Разговор прерывается телефонным звонком. Ночью Малдера видели входящим в здание ФБР. В своем офисе Доггетт выясняет у Скиннера, кто мог воспользоваться пропуском Малдера, чтобы войти в здание ФБР. Доггетту привозят могильный камень с кладбища, где похоронена вся семья Малдеров. На камне выбиты имена и даты смерти Уилльяма, Тины и Саманты. В нижней части камня появилась новая строка: "ФОКС МАЛДЕР, 1961-2000". Потрясенная Скалли смотрит на камень в отчаянии и неверии. Из медицинской карты Малдера Доггетт узнает, что Малдера убивала неестественная мозговая активность (эпизод #7X04). Малдер продолжал лечение в течение года. Доггетт выдвигает теорию о том, что Малдер, поняв, что его жизнь и работа оказались под угрозой, украл компьютеры, часть файлов, и разыграл свое исчезновение, чтобы не видеть как будут развенчаны его Секретные Материалы. Скиннер объявляет, что сам был свидетелем похищения Малдера, но Скалли умоляет Доггетта не включать слова Скиннера в рапорт. В офисе Скиннера Одинокие Стрелки отмечают на карте перемещение НЛО. Корабль летит к пустыне в штате Аризона. Дальнейшие его перемещения непредсказуемы. Ленгли высказывает предположение, что корабль может искать других людей, которых нужно забрать. Эта идея заставляет Скалли вспомнить о Гибсоне Прайзе (в последний раз появлявшемся в #6X01). Она приходит к выводу, что пришельцы собирают то, что могло бы стать доказательством их существования. В это же время под дверь в офис Доггетта подбрасывают конверт. Внутри Доггетт находит дело Гибсона Прайза. Команда Доггетта начинает новый поиск. Доггетт думает, что Малдер преследует Гибсона. Чтобы найти Малдера, нужно найти мальчика, которого в последний раз видели в Аризоне. Малдер привязан к операционному столу. Вращающееся лезвие опускается к его груди. Когда он начинает кричать, Скалли просыпается. Она в машине Скиннера, который наугад едет по дороге штата Аризона. Скалли и Скиннер не замечают вертолет, пролетающий высоко в небе над их машиной. Сидящий в вертолете Доггетт получает сообщение от одного из своих агентов, который обнаружил Гибсона в школе для глухих города Флеминг. Во время остановки в пустыне Скалли обращает внимание на странное дрожание раскаленного воздуха. Скалли решает, что увиденное ей показалось, не понимая, что заметила пролетевший космический корабль. Тем временем, Скиннер выясняет, что в Аризоне находится школа для глухих, где учится Гибсон. Директору школы сообщили, что Гибсона ищет ФБР. Вертолет Доггетта приземляется рядом со школой, и агент узнает, что мальчик исчез. Прибывшие Скалли и Скиннер потрясены при виде Доггетта. На вопрос Скалли, что он здесь делает, Доггетт отвечает: "Пытаюсь найти Малдера". Гибсон выбирается из школы, но его останавливает неизвестный человек. Доггетт идет по двум цепочкам следов на песке и, в конце концов, догоняет мужчину, который тащит за собой мальчика. Доггетт выхватывает пистолет и кричит: "Отпусти его!". Человек, держащий Гибсона, оборачивается к Доггетту. Это Малдер. ПРОДОЛЖЕНИЕ СЛЕДУЕТ