Пока противостояние между Скалли и Скиннером (из предыдущего эпизода) продолжается... Малдер врывается в свою квартиру и приказывает Скиннеру бросить оружие. Скиннер уступает, и достает из кармана компьютерный диск, содержащий совершенно секретные файлы министерства обороны о существовании внеземной жизни. Он объясняет, что диск представляет собой единственный способ привлечь убийц мистера Малдера к суду, и настаивает на том, чтобы диск остался у него. Малдер и Скалли рассматривают фотографию двадцатилетней давности, на которой изображены мистер Малдер и его коллеги из правительства. С помощью Одиноких Стрелков агентам удается установить личность одного из них: это человек по имени Виктор Клемпер, нацистский преступник, проводивший эксперименты на заключенных, а также участник операции "Скрепка" - операции правительства США, предоставившего убежище военным преступникам в обмен на их научные знания. Агенты собираются найти и допросить Клемпера, но тут Скалли узнает о том, что ее сестра Мелисса тяжело ранена и находится в больнице в критическом состоянии. Скалли порывается бежать в больницу, но Малдер убеждает ее отказаться от этой идеи - там может быть засада. Она соглашается и присоединяется к Малдеру в поиске Клемпера. Добродушный пенсионер Клемпер дает агентам немного информации: он сообщает, что снимок был сделан при горнодобывающей компании Стрейджхолд, а также упоминает константу Напьера, основу всех натуральных логарифмов. В полуразвалившейся шахте агенты обнаруживают тяжелые металлические двери, встроенные прямо в каменные стены склона горы. Малдер и Скалли проникают внутрь, открыв дверь при помощи известного им кода - константы Напьера. Там они находят гигантский архив, содержащий файлы и образцы тканей миллионов граждан США. Их поиск прерывает пролетающий по небу НЛО. В то же самое время группа войск особого назначения окружает здание. Малдер прорывается под огнем и уходит от преследователей. Вместе со Скалли он находит путь к бегству, и им удается беспрепятственно скрыться. Скиннер наносит визит в больницу, где находится Мелисса Скалли. Там он встречается с миссис Скалли и Альбертом Хостейном, молящимся за выздоровление Мелиссы. Скиннер настораживается, заметив странного типа, наблюдающего за палатой. Он пытается догнать этого типа, но на лестнице его атакуют Крайчек и его сообщник. Они оглушают Скиннера и забирают у него компьютерный диск. Малдер и Скалли снова приезжают к Клемперу, но у него дома их встречает Человек-с-хорошим-маникюром, который сообщает, что Клемпер мертв. Малдер узнает в нем одного из людей на фотографии его отца. Человек-с-хорошим-маникюром рассказывает, как в 1947 году разбившийся космический корабль был, по сообщениям, восстановлен в Нью-Мексико. Это событие совпало с началом операции "Скрепка". Малдер подозревает, что Клемпер проводил эксперименты по созданию супер-расы гибридов людей и инопланетян. Папки, собранные в архиве в горе, как предполагает Малдер, содержат записи о вакцинации сотен миллионов американцев, получивших прививку от оспы - таким образом, база данных содержала образцы ДНК практически всех детей, родившихся после пятидесятых. Скиннер угрожает Курильщику обнародовать информацию с диска, если будет причинен хоть какой-нибудь вред агентам Малдеру и Скалли. Он сообщает, что Альберт Хостейн, который прочитал эти файлы от начала до конца, распространил их содержание среди своих соплеменников по старинной устной традиции. Позже Малдер навещает Скалли в больнице и узнает, что Мелисса скончалась во время операции.